Le cofinancement européen est limité par un taux maximum fixé par axe prioritaire. Ce taux peut être modulé en fonction de plusieurs critères (Articles 120 et 121 du règlement UE 1303/2013). Le taux de cofinancement maximum à l’échelle de l’opération, qui peut être inférieur ou supérieur au taux de l'axe prioritaire, est contractualisé entre l’autorité de gestion ou l’organisme intermédiaire et le bénéficiaire lors du conventionnement.